曾用刊名：南京农学院学报
《南京农业大学学报》（以下简称学报）为综合性农业学术期刊，1956年9月创刊，双月刊。主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、食品科学与技术、农业化学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、综述和研究简报。
  学报为全国中文核心期刊，《中文核心期刊要目总览》连续5版均收录学报；学报为《中国科学引文数据库》（CSCD）核心期刊，中国科技论文统计源期刊。学报被美国《化学文摘》（CA）、美国《史蒂芬斯全文数据库》（EBSCO host）、美国《乌利希期刊指南（网络版）》（Ulrichsweb）、英国《动物学记录》（ZR）、英国《国际农业与生物科学中心》数据库(CABI)和日本科学技术振兴机构文献数据库（JST）等国外数据库和文摘收录。
 近年来，学报荣获“首届江苏省新闻出版政府奖报刊奖”，“2012中国国际影响力优秀学术期刊”，8次被评为“百种中国杰出学术期刊”，连续5届被教育部科学技术司评为“中国高校精品科技期刊”，2次被遴选为“中国精品科技期刊”，连续4年荣获“中国科技论文在线优秀期刊一等奖”，还荣获“江苏省双十佳期刊”、江苏期刊明珠奖、全国高校科技期刊优秀编辑质量奖等30多个奖项。
学报影响因子等学术计量指标也是稳中有升，在同类期刊中处于领先地位。
学报国内外公开发行，全国各地邮局订阅，国内邮发代号28–53，国外邮发代号：Q5785，ISSN 1000–2030，CN 32–1148/S。